结构产生和变异操作
\(\triangleright \) variable symmetries
Meaning: 晶体可能的空间群，二维晶体/表面的平面群组，或者是团簇的点群。在该列表中用随机选择的对称群，用随机生成的晶格常数和原子坐标产生确定结构数。 在这个过程中，从普通位置上将生成特殊的威科夫（Wyckoff）位置(Fig. ??)。
Default: 对三维晶体: 2-230 对二维晶体/表面: 2-17 团簇: E C2 D2 C4 C3 C6 T S2 Ch1 Cv2 S4 S6 Ch3 Th Ch2 Dh2 Ch4 D3 Ch6 O D4 Cv3 D6 Td Cv4 Dd3 Cv6 Oh Dd2 Dh3 Dh4 Dh6 Oh C5 S5 S10 Cv5 Ch5 D5 Dd5 Dh5 I Ih
Format:
% symmetries
195-198 200 215-230
% EndSymmetries
![\includegraphics[scale=0.3]{pic/Wyckoff_positions}](images/img-0010.png)
\(\triangleright \) variable fracGene
Meaning: 通过遗传所产生的结构所占的百分比； 0.1 means 10%, etc.
Default: 0.5
Format:
0.5 : fracGene
\(\triangleright \) variable fracRand
Meaning: 通过空间群随机产生的结构所占的百分比。
Default: 0.2
Format:
0.20 : fracRand
\(\triangleright \) variable fracTopRand
Meaning: 通过拓扑随机器产生的结构所占的百分比。
Default: 0.2
Format:
0.20 : fracTopRand
\(\triangleright \) variable fracPerm
Meaning: 通过置换所产生的结构所占的百分比；0.1 means 10%，etc.
Default: 0.1 如果有超过一种类型的原子/分子； 0 其他情况。
Format:
0.1： fracPerm
\(\triangleright \) variable fracAtomsMut
Meaning: 指定通过软模变异或交换所产生的机构所占的百分比。
Default: 0.1
Format:
0.1 : fracAtomsMut
注意: 你可以通过指定softMutTill用软模变异或协同变异。
\(\triangleright \) variable fracRotMut
Meaning: 通过分子取向变异所产生的结构所占的百分比。0.1代表10%，等等； 0.1 means 10%, etc.
Default: 0.1 对于分子晶体； 0 其他情况
Format:
0.1 : fracRotMut
\(\triangleright \) variable fracLatMut
Meaning: 由晶格变异所获得的结构的百分比。0.1代表10%，等等。; 0.1 means 10%, etc.
Default: 0 固定晶胞预测； 0.1 其他情况
Format:
0.1 : fracLatMut
注意: 如果所有分数的总和 (fracGene + fracRand + fracPerm + …) 不等于1,它们将会被重新调节。
\(\triangleright \) variable fracSpinMut
Meaning: 通过由自旋突变所产生的结构所占的百分比，0.1代表10%， 等等。
Default: 0.1
Format:
0.2 : fracSpin
注意：
(1)当运行一个自旋状态突变时，将会产生不同于初始磁性状态的新状态。 例如，在突变后，FM-L态绝对不会仍处在FM-L态，而可能会停留在NM和FM-H状态等等。 对AFM状态，在突变后可能仍处在AFM态，但是可能会伴随有原子的自旋向上或自旋向下的调整。 (2)新的状态突变的比率由 magRatio（磁性比率）决定。
\(\triangleright \) variable howManySwaps
Meaning: 对置换来说，互换原子对的数量由在1和howManySwaps 之间的统一分配所随机决定。
Default: 0.5\(\times \)(可能的互换原子对的最大值). 如果原子\(Na\)和\(Nb\)，原子\(Nc\)和\(Nd\)发生了互换，那么可能的互换原子对的总数是 \(\min (Na,Nb)+\min (Nc,Nd)\)，并且howManySwaps的默认设置为 \(0.5\times [\min (Na,Nb)+\min (Nc,Nd)]\)。在许多情况下，采用默认值是一个不错的选择。
Format:
5 : howManySwaps
\(\triangleright \) variable specificSwaps
Meaning: 明确在置换中允许哪种原子类型发生互换。
Default: 空行，这意味着没有明确的互换，所有的原子都发生了置换。
Format:
% specificSwaps
1 2
% EndSpecific
注意: 在这种情况下，第一种类型的原子可以与第二种类型的 原子发生互换。如果你想要尝试所有可能的互换，在该关键块里留一空行，或者删除这一部分。
\(\triangleright \) variable mutationDegree
Meaning: 在软模变异的位移的最大值的单位是 \(\text{\r{A}}\). 设置了软模变异和协同变异的最大位移矢量使其最大位移等于mutationDegree。
Default: 3\(\times \)(平均原子半径)
Format:
2.5 : mutationDegree
\(\triangleright \) variable mutationRate
Meaning: 晶格变异的应变矩阵的标准偏差的极小值。应变矩阵部分从 高斯分布中随机选择，并且只允许取-1到1之间的值。晶格变异的本质上是把准动力学的 思想融入到了我们的方法中 22 ，新的结构是由一些 异质结构的晶胞扭曲产生的。不像在准动力学中，在我们的方法中，变形是不累积的， 所以弹性部分可以足够大去获得新结构。
Default: 0.5
Format:
0.5 : mutationRate
晶格变异与较弱的软模变异结合在一起时一个好选择:
\(\triangleright \) variable DisplaceInLatmutation
Meaning: 将软模变异指定为晶格变异的一部分， 并且设置最大位移的量级为 \(\text{\r{A}}\).
Default: 1.0
Format:
1.0 : DisplaceInLatmutation
\(\triangleright \) variable AutoFrac
Meaning: 程序根据计算的演变，自动分配对变量算符所占的百分比（参数控制）。 这使得计算速度加快了两倍左右。当要选择用户自定义变异操作时，设置AutoFrac=0。
Default: 0
Format:
1 : AutoFrac