8.4 如何基于已知片段预测结构

有时候你已经知道你的结构是基于一些结构基元的堆叠。你可以告诉程序只根据这些“伪分子”来产生结构。 同时，你仍然可以使用标准的方法来产生子一代结构（如遗传和变异），标准方法将结构作为原子晶体对待， 因此会打破已预先定义的结构基元。为激活相关程序，你只需要常规的INPUT.txt文件，

% atomType
B
% EndAtomType

% numSpecices
48
% EndNumSpecices

假设你想根据硼二十面体产生结构，需要一个额外的MOL_1文件：

B12_[4]
Number of atoms: 12
B  -1.591325  -0.618615  -0.217220     0 0 0   0
B  -0.574110  -0.095870  -1.619670     1 0 0   0
B  -1.211325   1.134555  -0.455665     2 1 0   0
B  -1.158010   0.414740   1.203810     3 2 1   0
B  -0.487865  -1.260560   1.065420     4 3 1   0
B  -0.126980  -1.576135  -0.679575     5 4 1   0
B   0.487845   1.260560  -1.065430     3 2 1   0
B   0.127000   1.576130   0.679585     4 3 1   0
B   0.574120   0.095870   1.619670     5 4 1   0
B   1.211315  -1.134555   0.455685     6 5 1   0
B   1.158015  -0.414735  -1.203800     2 6 1   0
B   1.591320   0.618615   0.217195     7 8 3   0

该文件的格式在中有说明。唯一的区别是我们需要在文件的头部写入一些额外信息。 如上例所示，该处的信息说明4个MOL_1（B12）将会被使用，这与在INPUT.txt文件中描述的48个B原子是一致的。 这里的一致性是必须的，否则的话片段功能就不会被激活，即使你放置了MOL_x文件。如果你的设置是正确的， 你会在OUTPUT.txt中找到关于该特征的信息。

对于二维晶体，这种情况下你需要去指明两种厚度。

4.0   : thicknessS (it specifies the overall thickness of 2D crystal )
0.0   : thicknessB (it specifies the thickness of the molecular centers)

目前，可以再模块300和-200中使用这一功能。注意你无法同时使用单块体和片段功能。 强烈推荐，晶胞参数已知的情况下，在定胞模块中使用这一功能。