4.9 指纹设置

在改变下面这些参量之前,建议你先读一下关于指纹概念和方法论的文章,这样你才能知道你 在设置的是什么(Oganov & Valle, 2009 )。

$\triangleright $ variable RmaxFing

Meaning: 截断距离 (单位 $\text {\r{A}}$)。

Default: 10.0

Format:

10.0 : RmaxFing

$\triangleright $ variable deltaFing

Meaning: 是指纹函数的离散化 (单位 $\text {\r{A}}$)。

Default: 0.08

Format:

0.10 : deltaFing

$\triangleright $ variable sigmaFing

Meaning: 是原子间距的高斯扩展。

Default: 0.03

Format:

0.05 : sigmaFing

toleranceFing(默认值为0.003)和toleranceBestHM(默认值为0.02) 指定了结构之间的最小余弦距离,证明它们是不相同的——分别用于产生子代和适者生存。 它们依赖于结构弛豫的精度和体系的物理性质(例如对于排序问题,分别属于不同结构的指纹 非常相似,并且参数公差也设得非常小)只有当dynamicalBestHM=1时(我们 已不用了),toleranceBestHM才是有用的,所以这个参数基本上被废弃。