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假设计算所在文件目录是
/StructurePrediction，当按照序列运行USPEX， 这个目录下将会包含：
文件 INPUT.txt, 在 4章节中进行了详细讨论.
Subdirectory /StructurePrediction/Specific/ 和 VASP, SIESTA 或者 GULP (etc.) 等软件的可执行文件，列出结构弛豫的输入文件 — INCAR_1, INCAR_2, …,和赝势文件。
Subdirectory /StructurePrediction/Seeds 中包含种子文件， 其中列出了成分/反成分。注意种子文件应该是VASP5 POSCARS 格式来写入并 以POSCARS或者POSCARS_gen (gen（gen是代数）来对文件进行 命名。成分compositions和反成分Anti-compositions文件用来控制在变成分 或者单程序段计算中成分的变化。
Subdirectory /StructurePrediction/AntiSeeds—你可以在这 里放一些在计算中希望避免产生的特殊的结构，或者不需要明确指定任何结构而使用反种子技术 （避免一些在运行中发现的结构）
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